单细胞表达分析系统更有效的测序可以更低的成本实现更高的通量:由于与高通量实验方法相关的测序成本,单细胞实验往往非常昂贵。BD Rhapsody单细胞分析系统设计有多个功能,可以更有效地利用测序来降低实验成本。
靶向测定-由于检测灵敏度的提高,特定的基因组合方法可使用少量的时间和成本,帮助产生类似于全转录组分析(Whole Transcriptome Analysis,WTA)测定的结果。这种方法还提高了UMI计数效率,从而极大程度的节省了实验时间和成本。
储存-从样本中得到的完整cDNA可在磁珠上稳定存储,允许将珍贵样本保存长达16周。这可使用户在时间允许的情况下灵活地对样本进行测序,并通过对储存的磁珠池进行等分或分样来实现同一样本的多个测定。
分样-在磁珠上储存的cDNA可以分成一个或多个等分试样,并使用定制或预先设计的组合(panel)进行扩增。通过提供对部分样本进行测序的选项和对样本不同组合(panel)进行测试的灵活性,分样可降低成本。
单细胞分离和mRNA标记流程:
1.在微孔中,一个细胞与一个条码标记磁珠匹配
2.裂解细胞将mRNA与磁珠上条码标记的捕获寡核苷酸杂交
3.磁珠回收
4.cDNA合成
5.测序和构建单细胞基因表达谱
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