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精品网站在线免费观看 PCR凝胶电泳问题,全都总结出来了!

时间:2024/5/31阅读:1296
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1.Marker相关问题

1.1Marker 不直,偏斜或拖尾

原因:

1.胶配制的问题,制作不均匀或有污染或琼脂糖质量不好;

2.电泳缓冲液过于老旧,考虑更换;

3.电压太高,凝胶受热导致不均匀;

4.电泳槽的电极歪斜;


1.2Maker 跑不开

原因:

1.胶浓度太大;

2.电泳时间太短;


2.PCR产物相关问题

2.1没条带

原因:

没跑出来


2.2条带微弱

原因:

1.DNA降解

2.上样量过少

3.没跑出来,产物浓度过低,需再次PCR


2.3非特异性扩增

原因:

1.引物设计不合理。需重新设计引物,balst检测引物特异性;

2.试剂被污染。包括水,酶,引物等。重新更换;

3.退火温度太高。提高退火温度,增加退火时间,减少循环数;

4.酶加入过多;


2.4 PCR产物弥散,拖尾或偏斜,Maker正常

原因:

1. 引物保存不当,降解。重新配制引物工作液。

2.模板降解或过量。重新检查模板质量,减少模板用量。

3.非特异性扩增。提高退火温度,增加退火时间,减少循环数。

4.酶量过多或酶的质量差。

5. 有蛋白和盐的污染。


2.5 PCR产物和Maker 都弥散或拖尾

原因:

1.胶配制的问题,制作不均匀或有污染或琼脂糖质量不好;

2.电泳缓冲液过于老旧,考虑更换。

3.电压太高,凝胶受热导致不均匀。


2.6 PCR产物与目的大小不符合

原因:

1.引物特异性不好。需重新设计引物,balst检测引物特异性。

2.存在新的异构体。

3.是目的基因,但大小有差异(我遇到过)。胶回收过后再次电泳条带变为正常大小。遇到这个情况可以测序看看结果。


2.7 电泳孔亮

原因:有蛋白或者多糖的污染,这些大分子物质影响了DNA或RNA的出孔,使其停留在孔中或者出孔很慢。导致孔以及接近孔的位置很亮。

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