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PCR常见类型及PCR反应基本步骤
阅读:829 发布时间:2023-5-15聚合酶链反应技术(Polymerase chain raction ,PCR)是一种在体外扩增特定DNA片段的方法,具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点,可用很短时间使目的基因或某一片段扩增十万乃至几百万倍。
一、PCR常见类型
常规PCR:
直接PCR是指直接从样品扩增目标DNA,无需进行核酸分离纯化。
热启动PCR:
热启动PCR常用于增强PCR扩增的特异性。该方法主要利用抗体、亲合配体、适体或化学修饰物等酶修饰酶,来抑制室温下的DNA聚合酶的活性。这种修饰使得在PCR体系配制阶段引物与模板、引物与引物之前的结合能力降低,从而避免了非特异性扩增。
巢式PCR:
巢式PCR是标准PCR的一种演变,其增强了反应特异性和目标扩增子的产量。
快速PCR:
在快速PCR中,通过缩减PCR步骤所需时间来完成更快的扩增,且不会影响扩增产量和效率。快速循环条件尤其适用于具有高扩增能力的DNA聚合酶,这类聚合酶在每个结合中可引入更多的核苷酸。
高GC含量PCR:
具有高GC含量(>65%)的DNA模板由于G和C碱基间的强氢键影响,比较难以扩增。富含GC的序列同时也涉及二级结构。因此,富含GC的序列可导致DNA聚合酶沿模板扩增时“卡顿"并干扰DNA合成。
多重 PCR:
多重PCR可在同一PCR反应管中同时扩增多个不同的片段。多种PCR不仅意味着节省时间、试剂和样品,还能够同时对比多个扩增子
长片段 PCR:
长片段PCR通常是指扩增大于5kb的DNA片段。长片段PCR传统上使用 Taq DNA 聚合酶(用于快速延伸)和高保真酶(用于提高准确性)的混合物。
定量PCR:
序列的扩增程度(得率)取决于模板起始量,PCR常用于对样品中的DNA进行定量,其中,最常见的应用是 基因表达定量。
二、PCR反应基本步骤
变性:根据DNA高温变性的原理,将反应体系温度升至变性温度(高于模板熔点,约95℃),使目的DNA双链裂解成PCR模板(单链)。[95℃,30s]
退火:将反应体系温度骤降至退火温度(低于引物熔点约55℃),是PCR引物与PCR模板3’端杂交,称为退火。[55~65℃,30s]
延伸:将反应体系温度升至延伸温度(约72℃),DNA聚合酶按照碱基配对原则在引物3’端以5’→3’方向催化合成PCR模板新的互补链,使目的DNA拷贝数增加1倍。[72℃,30~60s]