2023年第二季度已经结束，又到了陈老湿交季报的时间。这个季度的国内Octet® 文章涵盖了蛋白、小分子等多种应用，并包含多篇CNS。从那么多高水平文章中不难看出：Octet® 非标记分析互作系统是一台功能强大、应用广泛、经济高效的好仪器！今天，我们统计了约60篇文章的单位和应用方向（见文末）与大家分享。

Octet® 文献单位统计

Octet® 应用方向

中山大学、南京大学和南京农业大学等多个单位发表的文章在两篇以上。从应用方向上看，依旧涉及到多个方向，其中小分子的应用文章最多！生物层干涉（BLI）技术无流路、对溶剂（DMSO）不敏感、假阳性低、高通量、操作简单、低成本、仪器稳定性好等优点可以帮助研究人员更加快速和高质量的获得小分子亲和力数据；而且还具备垂钓（用已知物质垂钓未知物质进行鉴定功能）、多聚物和定量方法开发等应用。

武汉大学Nature

揭示害虫取食与植物反取食的分子机制[1]

褐飞虱是对水稻造成损失最严重的害虫之一。BISP（BPH14-Interacting Salivary Protein）在褐飞虱唾液腺中高表达，是抑制水稻害虫防御的重要蛋白。武汉大学何光存课题组表达并纯化了受体BPH14——当BISP进入水稻细胞后，它会立即与BPH14发生特异性结合而被识别，激发强烈的抗虫反应，从而阻止了褐飞虱的侵害，赋予水稻对褐飞虱的高抗性。Octet® 在这项研究中被用来检测BISP与BPH14的亲和力。

图1. Octet® 检测发现，BISP26-124结构域与BPH14的LRR结构域结合，但与BISP125-241不结合

陈老师点评

近年来，国内应用Octet® 发表的CNS文章层出不穷，这些优秀的文章充分证明了Octet® 非标记分子互作系统在揭示分子机理方面的重要价值。

中科院生化所

Octet® 互作仪和Incucyte® 联用文章[2]

动态调节整合素的激活和失活对于精确控制细胞粘附和迁移非常重要。本文确定了LRP12作为α4整合素激活的内源性跨膜抑制剂。LRP12细胞质结构域直接与α4整合素胞质尾部结合，并抑制talin与β亚基的结合，从而保持整合素无活性。在迁移细胞中，LRP12-α4相互作用使得诱导新生粘附（NA）翻转。LRP12的敲除导致NAs增加和细胞迁移增强。在文章中，赛多利斯Octet® 被用来检测LRP12和α4整合素的直接互作，Incucyte® 则被用来检测细胞迁移（划痕实验）。

图2. Incucyte® 结果显示，加入外源LRP12可以抑制细胞迁移；如果沉默LRP基因，可以增加细胞迁移

图3. Octet® 证明了LRP12细胞质结构域直接与α4整合素胞质尾部结合

陈老师点评

Octet® 作为分子水平互作研究的利器，结合Incucyte® 细胞水平表型研究应用，使得研究更加全面、深入，强强联合。

广西大学

适配子垂钓[3]

近年来，蝗灾在世界范围内频繁发生，引起了人们的高度关注。本文开发了一种便携式、独立的核酸适配子传感器来检测蝗虫信息素4-乙烯基苯甲醚（4VA），以监测蝗虫种群动态，实现蝗灾预警。文章使用Octet® 的垂钓方法获得了针对4VA的高亲和力适配子，其KD值为269.25±90.65nM的，并用此来建立传感器检测方法。

图4. 使用Octet® 传感器固化4-乙烯基苯甲醚（4VA），结合适配子库，然后用不同强度方法洗脱与4VA结合的适配子

陈老师点评

重要的事情说一万遍，Octet®是做分子垂钓实验的一把好手。

清华大学CELL

病毒受体结合机制[4]

塞姆利基森林病毒（SFV）是一种在脊椎动物宿主和昆虫媒介感染期间使用极低密度脂蛋白受体（VLDLR）作为受体的病毒。本文使用冷冻电子显微镜观察了VLDLR与SFV的复合物结构。研究发现：SFV的表面蛋白E1的DII结构域结合VLDLR的膜远端LDLR A类（LA）重复序列。在VLDLR的LA重复序列中LA3对SFV的结合亲和力最好。高分辨率结构解析结果也验证了这个结论。

图5. Octet® 测试发现，VLDLR的LA重复序列中LA3与E1 DIII的亲和力最高

陈老师点评

这里列出的数据仅为这篇文章中Octet® 检测数据的1/4，还有各种突变体的Octet® 检测亲和力数据，复合物结构解析还是要通过Octet® 互作来进行验证！

Octet® 非标记分子互作分析系统的优势在于：

非标记Direct binding是趋势，结果更准确;本文的三次重复结果非常一致

快速测定亲和力，更加定量化地表征分子互作; 比如本文也用了IP或者其他标记方法来测试受体与细胞因子的互作，最终还是需要用Octet® 来定量检测两者互作

无洗涤步骤，可测弱亲和力（解离快）

写入了美国药典，文章多，认可度广

万金油技术，可以用与检测DNA，小分子，蛋白质等各种生物分子

操作简便，耗材及维护成本低

最后，祝愿大家都可以用赛多利斯“神器”发好文章！

Octet®  Q2文献列表

High-affinity decoy protein, nFD164, with an inactive Fc region as a  potential therapeutic drug targeting CD47.Biomedicine & Pharmacotherapy 162 (2023) 114618

军科院，抗体

A procedure for producing an anti-AXL nanobody in E. coli.Protein Expression and Purification 207 (2023) 106268

中国海洋大学，抗体

Potent NTD-Targeting Neutralizing Antibodies against SARS-CoV-2 Selected from a Synthetic Immune System.Vaccines 2023, 11, 771

上海科技大学，抗体

Structural Insights into the Binding of Red Fluorescent Protein mCherry-Specific Nanobodies.Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 6952.

复旦大学，抗体

A Novel Rabbit Anti-Myoglobin Monoclonal Antibody’s Potential Application in Rhabdomyolysis Associated Acute Kidney Injury。Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 7822.

天津大学，抗体

Mpox multi-antigen mRNA vaccine candidates by a simplified manufacturing strategy afford efficient protection against lethal orthopoxvirus challenge。Emerging Microbes & Infections

中国科学院微生物研究所，抗体

Preclinical Evaluation of 9MW2821, a Site-Specific Monomethyl  Auristatin E-based Antibody-Drug Conjugate for treatment of Nectin-4-expressing Cancers。AACR

华西医院，抗体

Inside-out assembly of viral antigens for the enhanced vaccination。Signal Transduction and Targeted Therapy (2023) 8:189

中国科学院过程工程研究所，抗体

AMT-562, a novel HER3-targeting antibody drug conjugate, demonstrates a potential to broaden therapeutic opportunities for HER3-expressing tumors.

中山大学，抗体

African Swine Fever Virus I73R is A Critical Virulence-related Gene: A Potential Target for Attenuation。PNAS

上海兽医研究所，DNA

lincRNA RP24-315D19.10 promotes endometrial decidualization via upregulation of hnRNPA2B1。BBA - Molecular Basis of Disease 1869 (2023) 166762

重庆医科大学，RNA

A meet-up of acetyl phosphate and c-di-GMP modulates BldD activity for development and antibiotic production.Nucleic Acids Research, 2023

华东理工大学，RNA

Structural and biochemical characterization of Schlafen11 N-terminal domain.Nucleic Acids Research, 2023

病原生物学研究所，RNA

-参考文献-

[1] A tripartite rheostat controls self-regulated host plant resistance to insects.Nature,2023

[2] LRP12 is an endogenous transmembrane inactivator of a4 integrins. Cell Reports 42, 112667

[3] Development of functional nucleic acid sensor for detection of locust pheromone 4-vinylanisole.Chemical Engineering Journal 466 (2023) 143065

[4] Structure of Semliki Forest virus in complex with its receptor VLDLR.Cell,2023