土壤微生物生物量碳（Soil microbial biomass C）是指土壤中所有活微生物体中碳的总量，通常占微生物干物质的40%-45%，是反映土壤微生物生物量大小的最重要的指标。

土壤微生物生物量氮（Soil microbial biomass N）是指土壤中所有活微生物体中氮的总量，尽管仅占土壤有机氮总量的1%-5%，但是土壤中活跃的有机氮组分，其周转速率快，对土壤氮素循环及植物氮素营养起着重要的作用。

利用总有机碳/总氮分析仪测定土壤微生物生物量碳、氮原理：
新鲜土壤经氯仿熏蒸（24 h）后，被杀死的土壤微生物生物量碳，能够以一定比例被0.5 mol/L K2SO4 提取并被定量的测定出来，根据熏蒸土壤与未熏蒸土壤测定的有机碳（氮）量的差值和提取效率（转换系数KEC或KEN），估计土壤微生物生物量碳（氮）。
 
利用总有机碳/总氮分析仪测定土壤微生物生物量碳、氮方法：

准确称取12.50 g鲜土于铝盒中，均匀铺开（不可带入有机残体）。放入内置装有无醇氯仿小烧杯的真空干燥器，烧杯中放置碎纸片以便于观察沸腾情况，干燥器用凡士林密封后抽真空，真空度控制在-0.07 Mpa以下，使氯仿沸腾3-5 min（气温过低可能不会沸腾）。关闭阀门后，在25 ℃黑暗培养24 h，中间隔12小时可检查真空情况，并适当补抽真空。熏蒸结束后，打开阀门应听到空气进入的声音，否则应重做。去除带氯仿烧杯后再反复抽真空2-3次，排除氯仿。另称取一批同等重量的土壤样品放入浸提瓶中，黑暗放置24 h。

熏蒸结束后应立即将土样从铝盒中全部转移至浸提瓶中，并加入50 mL 0.5 mol/ L K2SO4溶液，200 rpm/min振荡30 min后过滤（或先离心再过滤）,滤液稀释20倍，过0.45微滤膜上机测定。提取液应立即分析，或在4 ℃保存。提取液保存时间过长（>20 h）会导致测定结果下降。低温保存下的土壤提取液会出现一些白色沉淀（K2SO4结晶），对结果测定没有影响，不必去除，但取样前务必摇匀。