核壳类色谱柱的特点：

首先，由于制备工艺的差异(核壳类色谱柱填料的制备首先是制备实心球，之后在其表面“涂覆”全多孔硅胶；全多孔性色谱柱填料多是“一次性成型”)，核壳类色谱柱填料颗粒的粒径分布相比全多孔色谱柱填料颗粒的粒径分布更加均一、连续。

其次是核壳类色谱填料的内核是实心球，导致该型填料具有更小的轴向扩散效应，体现在Van Deemter方程上，主要影响第二项参数dm，使得色谱峰轴向扩展减小。

后，由于实心球的存在，径向上的温度传递加快，使得温度分布更加均一，加速传质速度；此外核壳类填料颗粒的传质路径要比全多孔类填料短的多，使得传质速率与全多孔性填料相比更快。

上述三方面的原因，使得理论塔板高度得到很大程度上地降低，因而核壳类色谱柱具有比全多孔性色谱柱具有更高的柱效，更宽的佳流速范围，因而具有更高的分析速度以及更低的系统背压。

除上述之外，核壳类反相色谱柱与全多孔反相色谱柱相比，能够使用纯水相作为流动相而不会出现色谱柱柱内去湿(色谱柱塌陷)现象。