显微镜的的目镜和物镜在未使用前室没有安装的，因此，每次使用显微镜前，先要目镜和物镜安装上去。显微镜目镜的安装并不难，关键是安装显微镜的物镜，确保物镜安装的正确。由于物镜价格昂贵，为确保安全，建议在安装显微镜物镜时要用左手食指和中指托住，然后用右手将物镜装上去，这样即使没安装好，也不会摔到地上。
显微镜测微尺由于不同显微镜及附件的放大倍数不同，因此校正目镜测微尺必须针对特定的显微镜和附件(特定的物镜、目镜、镜筒长度)进行，而且只能在特定的情况下重复使用，当更换不同放大倍数的目镜或物镜时，必须重新校正目镜测微尺每一格所代表的长度。校正方法如下:
把目镜的上透镜旋下，将目镜测微尺的刻度朝下轻轻地装入目镜的隔板上，把镜台测微尺置于载物台上，刻度朝上。先用低倍镜观察，对准焦距，视野中看清镜台测微尺的刻度后，转动目镜，使目镜测微尺与镜台测微尺的刻度平行，移动推动器，使两尺重叠，再使两尺的“0”刻度*重合，定位后，仔细寻找两尺第二个*重合的刻度，计数两重合刻度之间目镜测微尺的格数和镜台测微尺的格数。因为镜台测微尺的刻度每格长l0μm，所以由下列公式可以算出目镜测微尺每格所代表的长度。例如目镜测微尺5小格正好与镜台测微尺5小格重叠，已知镜台测微尺每小格为l0μm，则目镜测微尺上每小格长度为=5×10μm/5=10μm用同法分别校正在高倍镜下和油镜下目镜测微尺每小格所代表的长度。
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